Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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