Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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