Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms