Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms