Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

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Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Rapgef4Q9EQZ6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Rapgef4Q9EQZ6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rapgef4Q9EQZ6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms