Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Rhox9Q9EQM5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rhox9Q9EQM5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rhox9Q9EQM5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rhox9Q9EQM5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox9Q9EQM5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rhox9Q9EQM5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rhox9Q9EQM5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rhox9Q9EQM5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rhox9Q9EQM5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rhox9Q9EQM5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rhox9Q9EQM5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Rhox9Q9EQM5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox9Q9EQM5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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