Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms