Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ropn1lQ9EQ00 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms