Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a3Q9DCP2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms