Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn3Q9DCB1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn3Q9DCB1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms