Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne8Q9DC53 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms