Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms