Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms