Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp2aQ9DB34 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms