Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms