Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ift43Q9DA69 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms