Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms