Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms