Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calr3Q9D9Q6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms