Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms