Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D979 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D979 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D979 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D979 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D979 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D979 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D979 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D979 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D979 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D979 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D979 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D979 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms