Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Borcs5Q9D920 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Borcs5Q9D920 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Borcs5Q9D920 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Borcs5Q9D920 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Borcs5Q9D920 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Borcs5Q9D920 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Borcs5Q9D920 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Borcs5Q9D920 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Borcs5Q9D920 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Borcs5Q9D920 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms