Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms