Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl17Q9D8P4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms