Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms