Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmigd1Q9D7L8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms