Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7H3

RtcA, RNA 3'-terminal phosphate cyclase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcAQ9D7H3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcAQ9D7H3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RtcAQ9D7H3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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