Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms