Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms