Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc81Q9D5W4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms