Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms