Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms