Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms