Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms