Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Efhc2Q9D485 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhc2Q9D485 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms