Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms