Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms