Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trappc6bQ9D289 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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