Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd2Q9D1L0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd2Q9D1L0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms