Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan11Q9D1D1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms