Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms