Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1aQ9D132 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms