Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis18aQ9CZJ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms