Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nde1Q9CZA6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nde1Q9CZA6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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