Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Snx7Q9CY18 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms