Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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