Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpainQ9CWY9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms