Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms