Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms