Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cnot11Q9CWN7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cnot11Q9CWN7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cnot11Q9CWN7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cnot11Q9CWN7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cnot11Q9CWN7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cnot11Q9CWN7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cnot11Q9CWN7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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